Voda je velmi cenným zdrojem, který je v současnosti ohrožen znečištěním a klimatickými změnami. Hlavní výzkumné aktivity na Energetickém ústavu se zaměřují na:

• Čištění průmyslových odpadních vod mechanickými, chemickými a fyzikálními metodami se silným závazkem ke konceptu minimálního vypouštění škodlivin.

• Čištění odpadních vod pomocí kavitace a pokročilých oxidačních procesů (výzkum vedl k několika patentům a licencím).

• Přeprava a skladování vody v městském a zemědělském prostředí.